湾岸署猎奇连环杀人事件已经过去了七年，台场一带的环境发生了翻天覆地的变化。不仅仅是拥有接待外国贵宾政要的飞机场、高速公路与变电所等基础设施的台场已经成为恐怖分子的经常袭击目标。为了更好地应对犯罪，湾岸署准备搬迁至安全设备更为完善的新湾岸署。这项任务的负责人，是晋升刑事课强行犯系系长的青岛刑警(织田裕二 饰)。

    离新湾岸署开署仪式，还剩下三天，青岛与部下夏美(内田有纪 饰)、和久(伊藤淳史 饰)等人都在为搬迁忙得不可开交。可偏偏就在这个时候，湾岸署的管辖区内不断有案情发生。先是保险库被抢劫,公共巴士被挟持，青岛等人的配枪被盗，接着又是连环杀人事件……

    警视厅派人在湾岸署立即在署内设立特别搜查本部，并派管理辅佐官鸟饲(小栗旬 饰)协助青岛展开全面搜查行动。可事情的发展出乎意料，犯罪分子竟然将湾岸署占领，毒瓦斯弹、TNT 炸弹，连番进行着袭击。第二天就是新湾岸署正式开署的日子了,这个节骨眼上却冒出了这样破天荒的大乱子!青岛他们能够将受困的同事们解救出来，他能顺利逮捕罪犯吗？

时隔七年，《跳跃大搜查线》终于重返银幕。金牌制作人龟山千广、编剧君塚良一、导演本广克行等，原班人马再次集结幕后。台前的演员阵容，也是全员回归。本片的剧情发展，配合现实也过了七年的时间。织田裕二扮演青岛晋升系长，柳叶敏郎扮演的室井已是警察厅的红人。曾在番外篇出现的“女青岛”内田有纪，将作为青岛的得力部下出现。重要配角“堇”深津绘里、“真下”中山裕介，以及“领导三人组”北村总一朗、小野武彦、齐藤晓，还是老样子。此外，片中还有几位新面孔：当红男星小栗旬出演协助青岛查案的鸟饲，实力派伊藤淳史扮演人气角色和久的外甥.